第43集
除掉華妃(蔣欣飾)之後,陵容(陶昕然飾)向皇后說起皇帝(陳建斌飾)稱甄嬛(孫儷飾)為 “莞莞”一事,皇后感到甄嬛(孫儷飾)帶來的威脅,因為“莞莞”是已故純元皇后的小名,甄嬛(孫儷飾)的封號也是由此而來,心生妒意。皇后唆使祺貴人讓其父瓜爾佳鄂敏在前朝挑撥皇帝(陳建斌飾)與甄遠道之間的關係。鄂敏奏報皇帝(陳建斌飾),甄遠道家中有文字獄主犯錢名世的詩集,皇帝(陳建斌飾)心生芥蒂。皇帝(陳建斌飾)本性多疑,在皇后的唆使下,察覺到甄嬛(孫儷飾)愛讀政要史書,內心不悅,有意疏遠。皇帝(陳建斌飾)為了制衡各方勢力,對平亂有功的臣子並未賦予太多實權,對功臣之女也並不十分寵愛,但也不冷落,太后讚賞皇帝(陳建斌飾)的做法,皇帝(陳建斌飾)再次提起隆科多之事,並希望皇額娘不要干政。
冊封禮前,甄嬛(孫儷飾)發現禮服有破損,便草率地穿著內務府送來的替代禮服前往受禮現場。皇后當場指認甄嬛(孫儷飾)身上的衣服系已故純元皇后的舊衣,皇帝(陳建斌飾)更是錯認甄嬛(孫儷飾)為純元;皇帝(陳建斌飾)被揭破秘密,尷尬惱怒,指責甄嬛(孫儷飾)冒犯純元皇后,將其囚禁於剛剛修繕完畢的碎玉軒,非召不得出,日常份例皆按答應的標準,並下令杖斃了內務府總管姜忠敏,就連當初做過甄嬛(孫儷飾)教引姑姑的芳若也被打發到了太后身邊。甄嬛(孫儷飾)始知自己原來一直都是純元皇后的替身,徹底心碎。眉莊(斕曦飾)冒死奔走於皇后與太后宮中為其求情,但兩宮都不願意出面干預此事。
第44集
禁足於碎玉軒的甄嬛(孫儷飾)傷心欲絕,而此時的碎玉軒猶如冷宮一般,連外面送來的食物都是餿的。眾人備受欺凌,甄嬛(孫儷飾)因病重暈倒。流朱為替甄嬛(孫儷飾)求醫,強闖碎玉軒大門,卻遭到侍衛阻攔;流朱救主心切,絕望之下撲向侍衛手中的刀刃,血流不止,侍衛不得已向皇帝(陳建斌飾)報告實情。皇帝(陳建斌飾)聞訊震怒,斥責侍衛失職,下令杖責侍衛首領,將內務府苟總管免職,命溫實初速救甄嬛(孫儷飾)和流朱;流朱終因傷勢過重死去。
甄嬛(孫儷飾)醒來後意外發現自己懷孕,為保腹中胎兒平安,請求皇后照顧自己身孕,承擔一切後果。皇后不願答應,太后告誡她不可一錯再錯,更不許她拿烏拉那拉氏家族的榮華富貴開玩笑。皇后奉太后懿旨在麟趾門思過,陵容(陶昕然飾)寬慰皇后,說娘娘不喜歡的孩子就不應該降生,陵容(陶昕然飾)由此更得皇后器重。甄嬛(孫儷飾)得知流朱為救自己而死,悲痛萬分。溫實初告訴甄嬛(孫儷飾),她所使用的舒痕膠中含有大量不易察覺的麝香,這才是導致她當年小產的根本緣由。甄嬛(孫儷飾)始知陵容(陶昕然飾)惡毒。
第45集
皇帝(陳建斌飾)表面上恢復了甄嬛(孫儷飾)嬪位的待遇,並允許她出碎玉軒,卻讓侍衛嚴加監視,形同囚徒,祺貴人等勢利小人更是對她不屑一顧。眉莊(斕曦飾)獲知甄嬛(孫儷飾)懷孕卻仍被禁足,欲以探望,卻因宮規森嚴而不能前往,求見皇上寬恕甄嬛(孫儷飾)也沒有任何效果,她囑咐溫實初要替自己照顧好甄嬛(孫儷飾)。鄂敏繼續在皇帝(陳建斌飾)面前讒言、詆譭甄嬛(孫儷飾)父親甄遠道,張廷玉等重臣也受鄂敏矇蔽,彈劾甄遠道不臣之心,皇帝(陳建斌飾)心生戒備,最終下旨將甄遠道革職收監,其家眷圈禁府中,甄氏敗落。太后為甄嬛(孫儷飾)腹中的龍子考慮,擔心她得知家族之事身體不妥,命孫姑姑傳信安撫甄嬛(孫儷飾)。
陵容(陶昕然飾)受皇后旨意,派新來的太監小貴子故意將甄父被大臣鄂敏告發革職入獄的訊息告訴甄嬛(孫儷飾),甄嬛(孫儷飾)一驚之下動了胎氣。事成之後,陵容(陶昕然飾)把小貴子毒死滅口。陵容(陶昕然飾)派人在甄父的牢房裡投放老鼠,甄父被咬傷,感染了鼠疫,生命垂危。甄嬛(孫儷飾)帶孕求見皇帝(陳建斌飾),皇帝(陳建斌飾)正在給純元皇后寫信,態度冷淡,堅決不肯原諒甄嬛(孫儷飾)的“大不敬”之罪,且表示已經決定將甄家流放寧古塔,只是不必給披甲人為奴;一句“菀菀類卿”讓甄嬛(孫儷飾)知道,原來皇帝(陳建斌飾)此前對自己的萬般寵愛只因自己的容貌與純元相似,一時之間痛心無比,受到刺激早產。甄遠道病體康復,與家人一道北上寧古塔,府邸被查抄,家中僕役皆被賣為奴婢。
第46集
甄嬛(孫儷飾)痛苦中早產下一女,取名綰綰(與純元皇后的小名菀菀同音),封號朧月,皇帝(陳建斌飾)興奮不已,主動提出重新封她為妃。甄嬛(孫儷飾)內心對皇帝(陳建斌飾)絕望,也深知自己身為罪臣之女,無法在宮中立足,自請離宮到甘露寺修行,以保朧月平安。甄嬛(孫儷飾)拜託敬妃收養女兒朧月,替自己撫養女兒長大成人。公主出生三天後,甄嬛(孫儷飾)毅然離宮,槿汐、浣碧主動隨行,眉莊(斕曦飾)、溫實初為其送行,被接回宮來的四阿哥弘曆也在碎玉軒門前長跪送行,碎玉軒其他宮人皆被遣往別處伺候。
甄嬛(孫儷飾)遷居甘露寺,帶發出家,法號莫愁,入寺後備受欺凌,眾尼姑皆以她是被皇帝(陳建斌飾)厭棄之人,讓她做砍柴、挑水、洗衣等粗活,明裡暗裡更是百般的欺負折磨。莞嬪離宮,皇后趁機提議晉封祺貴人為嬪,又否決了皇帝(陳建斌飾)晉封眉莊(斕曦飾)為嬪的提議,安插陵容(陶昕然飾)、祺嬪等人好生伺候皇帝(陳建斌飾),在宮中大肆擴張勢力,同時又賜給祺嬪珍貴的紅瑪瑙串,陵容(陶昕然飾)明明認出那是會導致不孕不育的紅麝香珠卻不敢說破,祺嬪愛不釋手,天天佩戴。眉莊(斕曦飾)為甄嬛(孫儷飾)的離去傷心不已。溫實初因其御醫的特殊身份,獲准往來宮中及甘露寺兩地之間,暗中保護甄嬛(孫儷飾)。果郡王獲知甄嬛(孫儷飾)出宮修行,趕來甘露寺探訪,為甄嬛(孫儷飾)帶來女兒朧月的畫像,安慰甄嬛(孫儷飾)思女之情。甄嬛(孫儷飾)感激。
第47集
皇后攜敬妃等一干嬪妃赴甘露寺進香,甄嬛(孫儷飾)躲在立柱後不願相見。甄嬛(孫儷飾)看到眉莊(斕曦飾)時過於激動被祺嬪發現。祺嬪故意踩在甄嬛(孫儷飾)手上,迫使其因疼痛出聲而暴露;甄嬛(孫儷飾)被迫以狼狽落魄之相出來見皇后等人,皇后得意之下,囑咐祺嬪告訴寺中住持不必善待甄嬛(孫儷飾)。陵容(陶昕然飾)慶幸少了一大對手,命人毒死了自己身邊伺候過甄嬛(孫儷飾)的侍女菊青,對外稱是病死,草草火化。眉莊(斕曦飾)回宮後求太后庇護甄嬛(孫儷飾),並自請入住甄嬛(孫儷飾)的碎玉軒為其守宮,甘受冷落。朧月深得皇帝(陳建斌飾)喜愛,敬妃撫養得也盡心盡力,卻因無意間在皇帝(陳建斌飾)面前說“公主長得像莞嬪”而遭到斥責,一名宮女更因失口說出公主的生母在宮外,竟被皇帝(陳建斌飾)下令杖斃。
太后眼見皇帝(陳建斌飾)此舉,由女及母,擔心甄嬛(孫儷飾)安危,暗中派遣芳若每月定期探望甄嬛(孫儷飾)。甄嬛(孫儷飾)偶遇果郡王生母舒太妃,二人十分投緣,當年舒太妃得先帝專房之寵,下賜長相思、金縷衣等珍貴之物。當今皇帝(陳建斌飾)登基,剪除了數位兄弟,舒太妃擔心兒子受害,主動離宮出家,在凌雲峰修行。甄嬛(孫儷飾)欲撮合浣碧與王爺的侍從阿晉相好,浣碧心中早已愛上果郡王,斷然拒絕了甄嬛(孫儷飾)的好意。眉莊(斕曦飾)在宮中備受冷落,唯有溫實初悉心照顧;眉莊(斕曦飾)越發愛慕溫實初,卻發現此人一心只掛念甄嬛(孫儷飾)一人。
第48集
果郡王多次向甄嬛(孫儷飾)暗表情意,均被回絕。宮中雖然皇后獨大,但皇帝(陳建斌飾)仍舊不時牽掛甄嬛(孫儷飾),皇后為此頗為頭疼。甘露寺眾尼不容甄嬛(孫儷飾)等人,更是秉承皇后的意志,靜白髮現甄嬛(孫儷飾)房裡有從宮裡送來的燕窩,趁機誣陷其偷盜,又硬說她得了肺癆,趕去了偏僻難行的凌雲峰。甄嬛(孫儷飾)之病其實並非肺癆,實為生產後身體虛弱,憂思過度,又在寺裡受盡辛苦,病情加重。果郡王允禮獲悉後帶阿晉冒著大雪策馬趕來相救,將甄嬛(孫儷飾)送到清涼臺休息,甄嬛(孫儷飾)被徹底感動。
溫實初牽掛甄嬛(孫儷飾),想盡辦法前來照顧,卻察覺出果郡王對甄嬛(孫儷飾)有意。甄嬛(孫儷飾)病重,允禮捨身相救,只穿內衣躺在雪地裡,待渾身冰涼後再去給甄嬛(孫儷飾)退燒,自己卻因此染了重病;甄嬛(孫儷飾)病情穩定後找到允禮,兩人的情感剛有一絲靠近時,皇帝(陳建斌飾)帶著敬妃、女兒朧月突然來到清涼臺探望允禮;甄嬛(孫儷飾)躲在屏風後看到女兒時百感交集,斷然拒絕允禮的一切好意。浣碧殷勤照顧得病的果郡王,表露愛慕之意,甄嬛(孫儷飾)病好後立即離開果郡王住處,前往凌雲峰禪房。
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